随着代料栽培技术的普遍应用，在黑木耳袋栽、香菇袋栽的基础上，发展出毛木耳短袋栽培和长袋栽培两种模式。短袋栽培是把培养料装在17厘米x34厘米的塑料袋中，经过灭菌、冷却、接种、菌丝培养，在出耳时即可进行吊袋栽培（与黑木耳代料栽培相似），也可进行墙式栽培。短袋栽培模式有利于进行机械化生产。长袋栽培模式的工艺及生产方法与香菇菌筒畦式栽培相似，仅是不需要经过转色阶段，当菌丝长满袋就开袋出耳。20世纪90年代又引进了中国台湾的栽培模式—集约化栽培。

集约化栽培主要是用于生产优质毛木耳—白背毛木耳。白背毛木耳是毛木耳的一个品种，通过控制栽培条件，使耳片的柔毛层长厚、颜色洁白不褐变，而子实层长成黑色，耳片一面黑一面白，商品外观好。